星哥
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2018-10-29 22:05 发起提问

2018-10-28 18:04 发起提问

2018-10-24 17:37 发起提问

2018-10-11 09:05 回答问题

老师,这是我的GFF文件里面一个基因第八列开始后面的截图

2018-10-10 20:00 发起提问

2018-10-09 17:22 回答问题

老师,我的基因位置信息里面的ID和基因组的ID是一样的。 可能我没有把问题说清楚,我在运行perl脚本,get_gene_weizhi.pl后得到的基因位置信息是这样的 下图是GFF文件的一部分 get_gene_weizhi.pl得到了一共2万多个结果,我的基因一共才六十几个,我查看了一下GFF文件,发现这2万多个结果(就是NW开头这一栏)是GFF里面所有注释的gene,也就是说不是按照我的基因ID来提取的基因位置,而是将所有基因位置都提取了出来。并且第一幅图里面,得到的位置信息没有第一列(也就

2018-10-01 18:12 发起提问

2018-10-01 12:39 回答问题

老师,是这样的,我的物种是川桑(Morus notabilis),没有收录在在Ensembl数据库,所以我是在川桑数据库下载的genome,gene,cds及protein。如下图 然后在NCBI上下载了川桑的GFF注释文件,如下图 老师,下图是我根据视频学习找到的基因ID然后运行perl脚本get_gene_weizhi,得到gene_weizhi.txt文件,如下图 老师,这儿我补充一点,川桑基因组数据库没有基因在哪条染色体上的信息,所以这里的结果就没有第二列出现基因ID的染色体位置,图中应该

2018-09-29 21:02 发起提问

2018-09-28 09:40 回答问题

谢谢老师的耐心讲解,非常感谢!