黄老师,基因家族共线性绘图时,自己所要分析物种的染色体文件family.ctl和MADS_box_family.txt从哪里下载?

2 个回答

omicsgene - 生物信息
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你得知道这两个文件里面存的是什么:?

family.ctl? 存的是拟南芥基因组染色体号,你如果要做你的基因组,你把里面的拟南芥的基因组染色体编号换成自己的,就可以了,不用去下载。

MADS_box_family.txt? 文件里面存的是某个基因组家族的所有基因,你换成自己基因组中分析出来的基因家族基因ID就可以了;

所以不是去下载,是自己根据自己研究的物种基因组信息,和自己鉴定的基因家族ID准备这样的两个文件就可以了;注意格式一致。

文件都是文本文件,你用editplus打开就可以编辑修改了;

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小学生

老师您好,我想问MADS_box_family.txt中存的是经过鉴定,筛选得到的最终的WRKY基因家族的ID吗?是不是WRKY_removed_redundant_and_confirmed_IDlist.txt这个文件中的ID,整理格式后得到的?

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